Contra 4 đánh dấu sự trở lại chiến tuyến của Bill Razer chống lại mối đe dọa của lũ quái vật ngoài hành tinh, nhưng lần này anh có thêm đồng đội là Solomon Caesar, một nhân vật độc quyền cho phiên bản di động được sáng tạo bởi Stephen Hendrick. (Konami đã tiến hành một cuộc thi sáng tạo một nhân vật rất thú vị cho Contra 4 Mobile để lấy ý tưởng của các fan về thiết kế nhân vật anh hùng cũng như cốt chuyện nền.) Bill và Solomon phái vượt qua 7 màn chơi đầy những kẻ thù ngoài hành tinh, từ những tên lính cơ bản đến những con trùm khổng lồ lấp đầy màn hình